SOP für die Erstellung von Tissue Micro Arrays (TMAs)
Prinzip
Dieses Dokument beschreibt die Schritte, die an der AG Tissue Research zur Erstellung von TMAs mit dem TMA Grand Master nötig sind.
- Überprüfen Sie bitte, dass die Form des Gewebes im Paraffinblock und des Schnittes auf dem Objektträger übereinstimmen. Bei der Erstellung des TMAs müssen der digitale Schnitt, das sogenannte Whole Slide Image, und ein Foto des Paraffinblocks (Spenderblock) überlagert werden. Um dies reibungslos durchführen zu können muss gewährleistet sein, dass die beiden Bilder genug Ähnlichkeit aufweisen um auch von Nicht-Patholog*innen korrekt überlagert werden zu können.
- Legen Sie bitte alle Objektträger neben den zugehörigen Block auf ein Transportablett.
- Listen Sie die Dateinamen, die beim Scannen der Objektträger vergeben werden sollen, in einer Tabellenkalkulation (z.B. LibreOffice Calc oder Microsoft Excel) auf. Die Dateinamen dürfen keine Leer- oder Sonderzeichen enthalten.
- Bitte speichern Sie die Tabellenkalkulation auf einer Festplatte und bringen Sie diese mit den Blöcken und den Objektträgern ins Büro (ADM 4.OG).
- Im ZMF Labor werden die Objektträger eingescannt. Wenn allen Objektträger fertig eingescannt sind bekommen Sie die Dateien (Whole Slide Images) und zusätzlich eine Installationsdatei der Software "SlideViewer" (3DHISTECH Ltd., Hungary) und das "SlideViewer"-Handbuch auf der Festplatte zurück.
- Wie Sie die Annotationen für die TMAs erstellen können finden Sie im Handbuch (Seite 36 - Annotationen TMA).
- Nachdem die Annotationen auf den Bildern gemacht sind, geben Sie die Festplatte bitte wieder im Büro (ADM 4. OG) ab.
- Damit sind alle Vorbereitungsschritte abgeschlossen und die TMAs können von der AG erstellt werden. Sie werden schließlich die fertigen TMA Blöcke und eine Tabellenkalkulation mit den Blockinformationen auf Ihrer Festplatte zurückerhalten.